Mcp Einfaches Pubmed

Was ist MCP Simple PubMed?

MCP Simple PubMed ist ein leistungsstarker Server, der für die Suche und Abfrage der PubMed-Datenbank für medizinische Arbeiten und Forschung konzipiert wurde. Er bietet den Nutzern eine effiziente Möglichkeit, auf ein umfangreiches Repository medizinischer Literatur zuzugreifen, was es Forschern, Gesundheitsfachleuten und Studenten erleichtert, relevante Studien und Artikel zu finden.

Funktionen von MCP Simple PubMed

• Benutzerfreundliche Oberfläche: Die Plattform ist mit Blick auf Einfachheit gestaltet, sodass die Nutzer problemlos navigieren und die benötigten Informationen ohne Schwierigkeiten finden können.
• Umfassende Suchmöglichkeiten: Nutzer können detaillierte Suchen mit verschiedenen Filtern durchführen, um die Ergebnisse basierend auf spezifischen Kriterien wie Veröffentlichungsdatum, Autor und Schlüsselwörtern einzugrenzen.
• Zugriff auf Volltexte: MCP Simple PubMed bietet häufig Links zu Volltextartikeln, sodass die Nutzer die vollständigen Forschungsarbeiten direkt aus den Suchergebnissen abrufen können.
• Regelmäßige Updates: Die Datenbank wird häufig aktualisiert, um die neuesten Forschungsergebnisse einzubeziehen, sodass die Nutzer Zugang zu den aktuellsten verfügbaren Informationen haben.
• Offener Zugang: Als öffentliches Repository ermöglicht MCP Simple PubMed jedem, seine Ressourcen ohne Abonnementgebühren zu durchsuchen und darauf zuzugreifen.

So verwenden Sie MCP Simple PubMed

1. Besuchen Sie die Website: Gehen Sie zur MCP Simple PubMed-Website, um auf die Suchoberfläche zuzugreifen.
2. Geben Sie Suchbegriffe ein: Geben Sie relevante Schlüsselwörter, Phrasen oder Autorennamen in die Suchleiste ein, um Ihre Abfrage zu starten.
3. Filter anwenden: Nutzen Sie die verfügbaren Filter, um Ihre Suchergebnisse basierend auf Veröffentlichungsdatum, Artikeltyp oder anderen Kriterien zu verfeinern.
4. Ergebnisse überprüfen: Durchsuchen Sie die Liste der Artikel, die Ihren Suchkriterien entsprechen. Klicken Sie auf die Titel, um Abstracts oder Volltexte anzuzeigen, wo verfügbar.
5. Speichern oder Teilen: Sie können Ihre Suchergebnisse speichern oder mit Kollegen teilen, um weitere Diskussionen oder Kooperationen zu ermöglichen.

Häufig gestellte Fragen

F: Ist MCP Simple PubMed kostenlos?

A: Ja, MCP Simple PubMed ist eine öffentliche Ressource und für alle Nutzer kostenlos zugänglich.

F: Wie oft wird die Datenbank aktualisiert?

A: Die Datenbank wird regelmäßig aktualisiert, um die neuesten Forschungsartikel und Veröffentlichungen einzubeziehen.

F: Kann ich über MCP Simple PubMed auf Volltextartikel zugreifen?

A: Ja, viele Artikel bieten Links zu ihren Volltexten, sodass die Nutzer die vollständigen Studien lesen können.

F: Welche Arten von Artikeln kann ich in MCP Simple PubMed finden?

A: Sie können eine Vielzahl von Artikeln finden, darunter klinische Studien, Übersichten, Metaanalysen und Fallberichte aus verschiedenen medizinischen Bereichen.

F: Wie kann ich den Support für MCP Simple PubMed kontaktieren?

A: Für Unterstützung oder Anfragen finden Sie in der Regel Kontaktinformationen auf der Website oder im Hilfebereich.

MCP Simple PubMed

An MCP server that provides access to PubMed articles through the Entrez API.

<a href="https://glama.ai/mcp/servers/5wlfb8i6bj"><img width="380" height="200" src="https://glama.ai/mcp/servers/5wlfb8i6bj/badge" alt="mcp-simple-pubmed MCP server" /></a>

Features

• Search PubMed database using keywords
• Access article abstracts
• Download full text when available (for open access articles available directly on PubMed)

Please note that the tool returns XML-ized version of full text. It is however more useful for AIs than a "human readable" text would have been as it gives them additional information about document's structure. At least, this is what Claude 3.5 Sonnet said he prefers.

Please also note that inability of this tool and possibly other tools to deliver a paper's full text may not be due to the fact that it is not available. When testing this tool I came across a paper that did not have full text on PubMed and when Claude accessed the publication URL (which we did get through DOI) using fetch he did get a "forbidden” error. However, I was able to access the very same page using a regular browser.

In other words if your AI assistant is not able to get the full text of a paper using this tool it is worth trying manually with a regular web browser.

Finally, this tool of course can’t give you access to paywalled/paid papers. You may be able to read them through your library access or – as a last resort – through a certain site that strives to make publicly funded research freely available.

Installation

Installing via Smithery

To install Simple PubMed for Claude Desktop automatically via Smithery:

npx -y @smithery/cli install mcp-simple-pubmed --client claude

Manual Installation

pip install mcp-simple-pubmed

Configuration

The server requires the following environment variables:

• PUBMED_EMAIL: Your email address (required by NCBI)
• PUBMED_API_KEY: Optional API key for higher rate limits

The standard rate limit is 3 requests / second. No rate limiting was implemented, as it is highly unlikely in the typical usage scenario that your AI would generate more traffic. If you need it, you can register for an API key which will give you 10 requests / second. Read about this on NCBI pages.

Usage with Claude Desktop

Add to your Claude Desktop configuration (claude_desktop_config.json):

(Mac OS)

{
  "mcpServers": {
    "simple-pubmed": {
      "command": "python",
      "args": ["-m", "mcp_simple_pubmed"],
      "env": {
        "PUBMED_EMAIL": "your-email@example.com",
        "PUBMED_API_KEY": "your-api-key" 
      }
    }
  }
}

(Windows)

{
  "mcpServers": {
    "simple-pubmed": {
      "command": "C:\\Users\\YOUR_USERNAME\\AppData\\Local\\Programs\\Python\\Python311\\python.exe",
      "args": [
        "-m",
        "mcp_simple_pubmed"
      ],
      "env": {
        "PUBMED_EMAIL": "your-email@example.com",
        "PUBMED_API_KEY": "your-api-key" 
      }
    }
  }
}

macOS SSL Certificate Fix

If you encounter SSL certificate verification errors on macOS (such as [SSL: CERTIFICATE_VERIFY_FAILED] certificate verify failed: self-signed certificate in certificate chain), you need to install the proper certificate bundle:

/Applications/Python\ 3.13/Install\ Certificates.command

Replace 3.13 with your Python version number. This script comes with Python installations from python.org.

You can also run it from the Finder:

If you perform this change while Claude Desktop is open you will need to quit it and start it again for it to take effect.

License

MIT License